« Données téléchargées » : différence entre les versions

De Poids-plume
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Cette page donne plus d'explications techniques sur les données téléchargeables pour chaque mangeoire  
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sur la plateforme [https://data.poids-plume.fr https://data.poids-plume.fr].  
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! Colonne !! Description !! Remarque
! Colonne !! Description !! Remarque
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| video_sqlid || ID de la vidéo (sql) || Pour usage interne
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| video_id || ID de la vidéo ||
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| local_path || Chemin d'accès à la vidéo || Chemin sur le serveur de traitement des données
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| feeder || Mangeoire || Nom de la mangeoire
| feeder || Mangeoire || Nom de la mangeoire
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| datetime || Timestamp de la prise de vue ||  
| datetime || Timestamp de la prise de vue ||  
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| tagged_by || Personne ayant annoté la vidéo || Souvent vide
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| tagged_on || Date/heure de l'annotation || Souvent vide
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| birdn || Nombre d'oiseaux présents || Maintenant inutilisé
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| favorite || Statut de favori || Si la vidéo est mise en avant ou non
| favorite || Statut de favori || Si la vidéo est mise en avant ou non
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| public || Statut public || Si la vidéo a été autorisée pour l'utilisation en dehors de l'asso
| public || Statut public || Si la vidéo a été autorisée pour l'utilisation en dehors de l'asso
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| sex || Sexe de l'oiseau ||  
| sex || Sexe de l'oiseau annoté ||  
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| species || Espèce annotée ||  
| species || Espèce annotée ||  
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| comment || Commentaire ||  
| comment || Commentaire ||  
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| thumbnail || Chemin vers la miniature || Rajouter http://data.poids-plume.fr au début pour télécharger le fichier
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| vidfile || Chemin vers la vidéo || Rajouter http://data.poids-plume.fr au début pour télécharger le fichier
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| birdweight || Masse estimée de l'oiseau || en g
| birdweight || Masse estimée de l'oiseau || en g
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| birdweight || Ecart-type de la masee estimée ||  
| birdweight_sd || Ecart-type de la masse estimée ||  
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| wgtgraph || Graphe de la courbe de poids correspondant à l'oiseau || Rajouter http://data.poids-plume.fr au début pour télécharger le fichier
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| duration || Temps passé par l'oiseau sur le perchoir || en secondes
| duration || Temps passé par l'oiseau sur le perchoir || en secondes
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| mdiff || MAD de l'estimation de la masse || Median absolute difference (MAD) de la masse autour du modèle estimé
| mdiff || MAD de l'estimation de la masse || Median absolute difference (MAD) de la masse autour du modèle estimé
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| okweight || Statut de l'estimation de la masse (OK ou non) || Obsolète
| okweight || Statut de l'estimation de la masse (OK ou non) || Obsolète (et pas forcément présent)
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| mov_index || Indice de mouvement dans la vidéo || de 0 à 1
| mov_index || Indice de mouvement dans la vidéo || de 0 à 1
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| asym || Assymétrie de la série temporelle de masse || Assymétrie (skewness) des valeurs de masse autour du modèle estimé
| asym || Assymétrie de la série temporelle de masse || Assymétrie (skewness) des valeurs de masse autour du modèle estimé
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| mean_lum || Luminance moyenne de la vidéo ||  
| mean_lum || Luminosité moyenne de la vidéo || Moyenne de sqrt(x) où x est la valeur R, V ou B d'un pixel de l'image (entre 0 et 1)
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| fingerprint || Empreinte de la vidéo || Une série de nombres qui quantifient la distribution de couleur des pixels dérivant de la couleur médiane dans la vidéo (3 séries de 24 valeurs séparées par des point-virgules, pour les trois canaux R/V/B).
| fingerprint || Empreinte de la vidéo || Une série de nombres qui quantifient la distribution de couleur des pixels dérivant de la couleur médiane dans la vidéo (3 séries de 24 valeurs séparées par des point-virgules, pour les trois canaux R/V/B). Voir aussi la méthode décrite [https://gitlab.com/poidsplume/poids-plume-processing/-/blob/master/R/video_reading.R#L278 dans le code correspondant].
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| birdn_auto || Nombre d'oiseau estimé à la mangeoire || Par ML
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| species_auto || Espèce estimée à la mangeoire || Par ML
| species_auto || Espèce estimée à la mangeoire || Par ML
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| model_hasbird_pred || Probabilité estimées d'un oiseau à la mangeoire || Par ML, entre 0 et 1
| model_hasbird_pred || Probabilité estimée d'un oiseau à la mangeoire || Par ML, entre 0 et 1
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| model_species_pred || Probabilité estimées de l'espèce || Par ML, entre 0 et 1
| model_species_pred || Probabilité estimée de l'espèce || Par ML, entre 0 et 1
|}
|}
"video_sqlid" "video_id" "local_path" "feeder" "owner_name" "owner_family_name" "date" "datetime" "tagged_by" "tagged_on" "birdn" "favorite" "public" "sex" "species" "comment" "thumbnail" "vidfile" "birdweight" "birdweight_sd" "wgtgraph" "duration" "wgtvar" "samples" "rmse" "mdiff" "okweight" "mov_index" "asym" "mean_lum" "fingerprint" "birdn_auto" "species_auto" "model_hasbird_pred" "model_species_pred"

Dernière version du 16 décembre 2020 à 12:26


Cette page donne plus d'explications techniques sur les données téléchargeables pour chaque mangeoire sur la plateforme https://data.poids-plume.fr.

Informations sur les colonnes[modifier]

Données interpolées[modifier]

Sur les mangeoires, tous les capteurs ne sont pas lus à la même fréquence. La mesure de température extérieure se fait uniquement toutes les quelques minutes, alors que le poids est mesuré plusieurs fois par seconde. Ce type de données résulte de la standardisation de toutes ces lectures de capteurs à des fréquences différentes à 5 Hz (donc 5 valeurs par seconde), de manière à obtenir une série temporelle homogène. L' interpolation n'est pas linéaire mais par plateau (la valeur précédent le pas de temps à interpoler est choisie pour chaque pas de temps).

Colonne Description Remarque
diskspace Espace disque Espace disque utilisé sur la mangeoire (en %)
envhumi Humidité extérieure Toujours zéro (le capteur n'est pas fonctionnel)
envpress Pression atmosphérique en hPa
envtemp Température extérieure en °C
loadavg Load average Load average sur une minute
systemp Température système Température reportée par le processeur
weight Masse Masse mesurée au perchoir (en grammes)
weightav Masse lissée Masse lissée
time Temps Date/heure de la mesure. En nombre de secondes depuis 1970-01-01 00:00, fuseau horaire de Paris.
battery_perc Charge de la batterie Absent sur la plupart des mangeoires
temp Température Absent sur la plupart des mangeoires

Données filtrées[modifier]

Les données filtrées représentent les même séries de données, mais avec certains traitement appliqués visant à retirer les valeurs aberrantes, lisser certaines valeurs (par ex. les valeurs de températures), et identifier la présence ou non d'un oiseau sur le perchoir.

Colonne Description Remarque
time Temps Date/heure de la mesure. En nombre de secondes depuis 1970-01-01 00:00, fuseau horaire de Paris.
diskspace Espace disque Espace disque utilisé sur la mangeoire (en %)
envhumi Humidité extérieure Toujours zéro (le capteur n'est pas fonctionnel)
envpress Pression atmosphérique en hPa, valeurs lissées
envtemp Température extérieure en °C, valeurs lissées
loadavg Load average Load average sur une minute
systemp Température système Température reportée par le processeur (lissée)
weight Masse Masse mesurée au perchoir (en grammes). Filtrée pour retirer les valeurs aberrantes du capteur.
weightav Masse lissée Masse lissée
battery_perc Charge de la batterie Absent sur la plupart des mangeoires
temp Température Absent sur la plupart des mangeoires
chunk Numéro de la séquence Le filtrage se fait par groupe de données lorsqu'un grand nombre de valeurs consécutives sont manquantes. Cette colonne indique le numéro de groupe.
wgtlow Masse mesurée (sans oiseau) Cette valeur représente la masse estimée au perchoir, en enlevant si nécessaire le poids d'un oiseau présent au perchoir
ishigh Présence d'un oiseau Cette valeur indique la présence d'un oiseau ou non au perchoir (par un 1 ou 0)

Visites[modifier]

Les données de visites correspondent aux vidéos prises par les mangeoires, avec leurs annotations.

Colonne Description Remarque
feeder Mangeoire Nom de la mangeoire
owner_name Prénom du propriétaire
owner_family_name Nom de famille du propriétaire
date Jour de la prise de vue
datetime Timestamp de la prise de vue
favorite Statut de favori Si la vidéo est mise en avant ou non
public Statut public Si la vidéo a été autorisée pour l'utilisation en dehors de l'asso
sex Sexe de l'oiseau annoté
species Espèce annotée
comment Commentaire
birdweight Masse estimée de l'oiseau en g
birdweight_sd Ecart-type de la masse estimée
duration Temps passé par l'oiseau sur le perchoir en secondes
wgtvar Variance de la série temporelle Variance de la série temporelle de masse pendant la vidéo (+ quelques secondes avant et après)
samples Nombre d'échantillons pour l'estimation de la masse
rmse RMSE de l'estimation de la masse Root-mean squared error de la série temporelle de masse autour du modèle estimé
mdiff MAD de l'estimation de la masse Median absolute difference (MAD) de la masse autour du modèle estimé
okweight Statut de l'estimation de la masse (OK ou non) Obsolète (et pas forcément présent)
mov_index Indice de mouvement dans la vidéo de 0 à 1
asym Assymétrie de la série temporelle de masse Assymétrie (skewness) des valeurs de masse autour du modèle estimé
mean_lum Luminosité moyenne de la vidéo Moyenne de sqrt(x) où x est la valeur R, V ou B d'un pixel de l'image (entre 0 et 1)
fingerprint Empreinte de la vidéo Une série de nombres qui quantifient la distribution de couleur des pixels dérivant de la couleur médiane dans la vidéo (3 séries de 24 valeurs séparées par des point-virgules, pour les trois canaux R/V/B). Voir aussi la méthode décrite dans le code correspondant.
species_auto Espèce estimée à la mangeoire Par ML
model_hasbird_pred Probabilité estimée d'un oiseau à la mangeoire Par ML, entre 0 et 1
model_species_pred Probabilité estimée de l'espèce Par ML, entre 0 et 1
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